南京生物醫藥谷地處南京西北部，長江北岸，國家級南京高新技術開發區內，是高新區專業特色子園區。其前身分別歷經江蘇省“三藥”示范基地、江蘇省南京新藥創業服務中心、江蘇省生物醫藥產業集聚區等階段。2010年，南京市委、市政府明確了以南京高新區現有的生物醫藥產業為基礎，逐步引導南京市生物醫藥產業向南京生物醫藥谷集聚，建設國家生物醫藥產業基地的發展戰略。2011年3月14日南京生物醫藥谷發展中心成立；同年3月25日，南京生物醫藥谷建設發展有限公司成立。
